发布时间:2022-08-15 浏览次数:4608
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科研技术服务平台多样 满足不同样本实验需求
▲伯豪生物(部分)技术平台展示
空间转录组是从空间层面上解析 RNA-seq 数据的技术,通过对组织切片、测序获得组织空间中的 mRNA 表达信息、 定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达 。
序号 | 技术服务 | 应用领域 | 样本 |
1 | FFPE 空间转录组测序 [科研服务] | ★肿瘤学; ★ 免疫学; ★ 生长发育; ★神经科学; ★病理学; ★多组学联合(例如:单细胞核转录组 + 空间转录组等) | FFPE (临床样本) |
2 | 空间转录组测序 [科研服务] | ★ 肿瘤学; ★免疫学; ★生长发育; ★神经科学; ★病理学 ; ★多组学联合(例如:单细胞转录组 + 空间转录组等) | 新鲜冰冻组织 |
普通转录组 VS 单细胞转录组 VS 空间转录组 | ||
普通转录组 得到组织中混合细胞(bulk)表达情况,无法解析细胞表达异质性,即无法得到每个细胞的表达情况。 | 单细胞转录组 10x genomics 等单细胞转录组测序技术可以得到每个细胞的表达情况,从而解析组织内细胞异质性。 | 空间转录组 10x visium 等将组织切片与转录组测序结合,实现空间信息和转录本信息的获取。添加基因表达空间分布信息,进一步提高组织内部分辨率。 |
序号 | 协助客户发表文章 | 杂志 | IF | 日期 | 提供服务 | 样本 |
1 | Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer | Nature Communications | 17.694 | 2022 | 空间转录组测序 | 组织 |
2 | Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome | Clinical and Translational Medicine | 8.554 | 2022 | 空间转录组测序 | 组织 |
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